除了非洲之外的现代人里有1%至4%的基因来源于尼安德特人，尼安德特人和智人是属于亚种的关系？渐变种？还是独立物种？还是同一物种？科学家迟迟没有下定义。我想也许是词穷了吧，下面我们透过现象看本质，看看科学家们为什么如此为难。
我们需要了解两件事：
（1）物种是什么
（2）智人和尼安德特人（下面简称尼人）的演化路线
物种的本质
个体之间能不能繁殖可育后代，直接原因并不是“产没产生生殖隔离”，“是不是同一物种”。物种、生殖隔离只是人类描述的概念。
物种的传承靠的是基因的传递，物种的演化直接因素也是基因。物种多样性，是基因多样性的表达。基因多样性的来源是基因突变、染色体变异和基因重组。
基因库的改变导致生殖隔离
我们把同一种群包含的所有基因，叫做这个种群的基因库。基因在种群中出现的频率，叫做基因频率。
当物种产生地理隔离，种群分居两地。假设过了亿年，这两个种群基因库没有太大差异，那么它们还是同一物种，并不会出现生殖隔离。
重点：
基因库没有太大差异，不是单纯指基因在亿年后没有发生变异，分为两种情况：
（1）基因库不变，原来什么样，现在什么样。
（2）基因库发生了微小的改变，比如：黑眼睛变蓝眼睛；白皮肤变黑皮肤；
还有一种可能没有导致生殖隔离：
（3）各自都演化出了新的物种，基因库出现很大的差异，但是演化方向接近，并没有产生绝对的生殖隔离。
生殖隔离
如果基因频率改变了，物种肯定进化了，但是不一定会产生生殖隔离，形成新的物种。生殖隔离条件是大量的基因频率改变的积累，促使基因库差异非常大。这样的结果就会形成新的物种，这是循序渐进的过程，需要足够的时间。
基因频率
上面说的黑眼睛还是蓝眼睛、白皮肤还是黑皮肤是基因库中个别的基因频率的改变，导致的性状改变。基因频率的改变是可遗传变异和基因重组自然选择的结果。
这个有点绕，举个粒子：
某种昆虫种群里突然变异出了一个外表颜色接近树木颜色的个体，刚好这种变异还可以遗传。由于这个颜色有利于保护自己不容易被发现，随着一代代繁衍，种群全变成了这种颜色。那么表现这个性状的基因，基因频率就由0变成了%。
搞清楚这些事情，接下来我们开始说说尼人和智人是什么情况。
直立人的出现
我们从万年前讲起吧，当时地壳运动，东非大裂谷形成，促使了裂谷东面的森林变成了草原。原本在树上栖息的猿猴，因为栖息的树木减少，不得不下地生活。由于环境突然的改变，下了地的猿猴为了适应地面、获取食物、节约能量，从四肢行走慢慢演化成了直立行走。经过了南方古猿、能人、匠人等几次演化后，在万年前，直立人诞生了。
走出非洲
晚期的直立人大脑容量达到了1毫升左右，平均身高达到厘米，已经很接近现代人了。直立人经过前面祖先的积累，已经点亮了很多技能，比如用火，制造石器，打猎采集什么的更不在话下。这些技能大大提升了能量获取的效率，也使得直立人具备了迁徙的能力。
非洲就像人才市场一样，一代又一代，一边演化着，一边往外输送人才，源源不断。直立人兵分好几路，走出非洲向外四处扩散。中国境内的北京人、蓝田人、元谋人等等，就是直立人迁徙产生的。
智人和尼人的诞生
大约在60万年前，直立人中出现了一个分支叫做海德堡人，海德堡人这个分支同样也跟前辈们一样向外迁徙，一部分在欧洲定居下来，叫做欧洲海德堡人。非洲也留下一部分继续深造，叫做非洲海德堡人。
25万年前，非洲海德堡人的演化出了早期智人。
23万年前，欧洲海德堡人的后代，尼安德特人也出现了。
当然同期还有很多分支，只是在这俩面前就有点不够看了。智人同样想冲出非洲这个牢笼，但是当时的尼人是欧洲的统治者，守着出关要道。智人第一次出关被打了回来，只有少部分人突围成功。大部分只能回炉再造，卧薪尝胆。当智人第二次发起冲锋时，势如破竹，直接秒掉了所有竞争对手，杀的杀，吃的吃，同化的同化，最后全世界只剩下了智人，也就是我们。
现代科学家发现，除非洲以外，大多数现代人的基因中有至少1至4%源自尼安德特人。智人冲出非洲时，还有一部分智人留在了非洲，也就是现在的非洲人，大部分非洲人基因里并没有尼人的基因。也就是说只有冲出非洲的智人与尼人发生了一些不可告人的事情。
我们回过头来看看智人与尼人的关系，首先他们有共同的祖先海德堡人，但是分隔两地的海德堡人，在不同的气候下沿着两个不同的方向演化着。
观点：
我认为之所以尼人并没有与智人发生绝对的生殖隔离，很大一部分原因就是他们的共同祖先，海德堡人已经离成功人士非常很近了。
海德堡人男性的平均身高为1.72米体重为62.5kg，拥有较大的脑容量，大约是1到毫升，高于现代人类的平均值毫升。他们已经具备了制造、学习一些复杂事物的能力，具备了基本的原始形态的语言。
他们已经可以依靠制作外物去抵抗环境对他们的筛选，在演化方向上占据了一定的主动。这种主动减弱了基因库的改变，智人也是如此。与其说他们在进化，不如说他们是从一个初步懂得抵抗环境的状态下分隔两地，然后在不同的环境下，继续抵抗，继续精益求精。他们演化主要方向和基因基础并没有太大的区别。
结论
尼人与智人的关系就是上文所提到的基因库变化（3），同一祖先，不同地域演化，没有产生绝对的生殖隔离。大自然演化是错综复杂而又神奇的，而定义只是为了学习研究，人为约定的，只有了解本质才能看清答案。
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